O HPTLC pode lidar facilmente com matrizes alimentares complexas e diversas. É usado para fins de controle de qualidade, para rastrear contaminantes de alimentos e para testar aditivos.
Os desafios analíticos de alimentos, rações e produtos relacionados são imensos. Um dos aspectos problemáticos é a complexidade e diversidade de matrizes nas quais os analitos devem ser determinados. O termo "Alimentos" significa qualquer substância comestível ou potável que contenha componentes nutritivos, como carboidratos, gorduras, proteínas, vitaminas e minerais essenciais, que sustentam a vida, promovem o crescimento, fornecem energia, etc.
HPTLC é uma técnica analítica flexível e económica. É usado para fins de controle de qualidade e para rastrear impurezas. Além disso, o HPTLC é usado para controle em processo e durante os procedimentos de validação de limpeza.